Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms