Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mmp11Q02853 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms