Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms