Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Lsm5P62322 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms