Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP98P52948 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP98P52948 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP98P52948 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP98P52948 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP98P52948 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP98P52948 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP98P52948 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP98P52948 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP98P52948 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP98P52948 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP98P52948 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP98P52948 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP98P52948 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP98P52948 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUP98P52948 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP98P52948 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP98P52948 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP98P52948 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP98P52948 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP98P52948 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP98P52948 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP98P52948 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP98P52948 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP98P52948 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP98P52948 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NUP98P52948 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP98P52948 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP98P52948 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP98P52948 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUP98P52948 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP98P52948 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP98P52948 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP98P52948 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP98P52948 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP98P52948 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP98P52948 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP98P52948 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP98P52948 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP98P52948 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP98P52948 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP98P52948 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP98P52948 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP98P52948 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP98P52948 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP98P52948 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP98P52948 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP98P52948 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP98P52948 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP98P52948 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP98P52948 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP98P52948 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP98P52948 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP98P52948 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP98P52948 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP98P52948 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP98P52948 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP98P52948 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP98P52948 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP98P52948 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP98P52948 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP98P52948 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP98P52948 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP98P52948 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP98P52948 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP98P52948 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP98P52948 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP98P52948 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms