Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACADSBP45954 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms