Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA4P41247 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PNPLA4P41247 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA4P41247 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA4P41247 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA4P41247 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms