Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP8P40818 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP8P40818 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP8P40818 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP8P40818 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP8P40818 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP8P40818 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP8P40818 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP8P40818 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP8P40818 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP8P40818 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP8P40818 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP8P40818 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP8P40818 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP8P40818 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP8P40818 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP8P40818 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP8P40818 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP8P40818 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP8P40818 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP8P40818 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP8P40818 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP8P40818 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP8P40818 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP8P40818 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP8P40818 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP8P40818 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP8P40818 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP8P40818 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP8P40818 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP8P40818 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP8P40818 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP8P40818 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP8P40818 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP8P40818 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP8P40818 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP8P40818 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP8P40818 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP8P40818 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP8P40818 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP8P40818 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP8P40818 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP8P40818 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP8P40818 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms