Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 ITC1YGL133W 3795 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 PHO81YGR233C 3537 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 ENA5YDR038C 3276 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 EMP70YLR083C 2004 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 PCL2YDL127W 927 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 CTH1YDR151C 978 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 PPX1YHR201C 1194 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 MTD1YKR080W 963 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 RPL8BYLL045C 771 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 YOR385WYOR385W 873 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 DBP5YOR046C 1449 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 NDC80YIL144W 2076 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 CEP3YMR168C 1827 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 SEC59YMR013C 1560 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 YPL109CYPL109C 1974 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 TFC1YBR123C 1950 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 YKL222CYKL222C 2118 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 SPO71YDR104C 3738 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 ACA1YER045C 1470 nt3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 YIL169CYIL169C 2988 nt3.15□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 CTM1YHR109W 1758 nt3.15□□□□□ -1.9
SHQ1P40486 YDL162CYDL162C 357 nt3.15□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.15□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.15□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.15□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.15□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt3.15□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YNR068CYNR068C 819 nt3.15□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 POS5YPL188W 1245 nt3.15□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YSA1YBR111C 696 nt3.15□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 ROM1YGR070W 3468 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 TRM12YML005W 1389 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 MSM1YGR171C 1728 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 TGL2YDR058C 981 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 RAD55YDR076W 1221 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 RPL1BYGL135W 654 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YHL045WYHL045W 348 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 ATG27YJL178C 816 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YJR128WYJR128W 360 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 TEM1YML064C 738 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YBL065WYBL065W 345 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YOL024WYOL024W 519 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 HHF1YBR009C 312 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 RPL1AYPL220W 654 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 BEM4YPL161C 1902 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 TEC1YBR083W 1461 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 TLC1TLC1 1301 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 VBA4YDR119W 2307 nt3.14□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YME2YMR302C 2553 nt3.13□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 ILS1YBL076C 3219 nt3.13□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 BCH1YMR237W 2175 nt3.13□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YDR290WYDR290W 330 nt3.13□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 SPT2YER161C 1002 nt3.13□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 SDP1YIL113W 630 nt3.13□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 IME1YJR094C 1083 nt3.13□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YLR444CYLR444C 303 nt3.13□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 HUB1YNR032C-A 222 nt3.13□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 HRD1YOL013C 1656 nt3.13□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YLR278CYLR278C 4026 nt3.13□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YOR365CYOR365C 2112 nt3.13□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 RCY1YJL204C 2523 nt3.13□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 EBS1YDR206W 2655 nt3.12□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 MSS4YDR208W 2340 nt3.12□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 MDV1YJL112W 2145 nt3.12□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 NIT3YLR351C 876 nt3.12□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 RPL6AYML073C 531 nt3.12□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 COX14YML129C 213 nt3.12□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YOR082CYOR082C 342 nt3.12□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YOR263CYOR263C 408 nt3.12□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 CAF20YOR276W 486 nt3.12□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 TAF3YPL011C 1062 nt3.12□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 RSE1YML049C 4086 nt3.11□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 CDH1YGL003C 1701 nt3.11□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 AST2YER101C 1293 nt3.11□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 AML1YGR001C 747 nt3.11□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 UNG1YML021C 1080 nt3.11□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 ROG1YGL144C 2058 nt3.11□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 STP2YHR006W 1626 nt3.11□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 MIP6YHR015W 1980 nt3.11□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YDR340WYDR340W 303 nt3.1□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 RPL23BYER117W 414 nt3.1□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.1□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 AIM25YJR100C 984 nt3.1□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 TUM1YOR251C 915 nt3.1□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YPR050CYPR050C 414 nt3.1□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YBR116CYBR116C 528 nt3.1□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 SMC2YFR031C 3513 nt3.1□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 ECM21YBL101C 3354 nt3.1□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 REG1YDR028C 3045 nt3.09□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YGR067CYGR067C 2415 nt3.09□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 TAO3YIL129C 7131 nt3.09□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YCR015CYCR015C 954 nt3.09□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YDL241WYDL241W 372 nt3.09□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 ADH4YGL256W 1149 nt3.09□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 RPS21BYJL136C 264 nt3.09□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.09□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 USB1YLR132C 873 nt3.09□□□□□ -1.91
SHQ1P40486 RIM9YMR063W 720 nt3.09□□□□□ -1.91
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