Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms