Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA11P31270 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA11P31270 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms