Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
DNMT1P26358 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms