Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTSSP25774 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTSSP25774 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTSSP25774 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTSSP25774 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSSP25774 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSSP25774 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSSP25774 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSSP25774 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSSP25774 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSSP25774 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSSP25774 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSSP25774 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSSP25774 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSSP25774 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTSSP25774 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTSSP25774 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTSSP25774 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms