Protein–RNA interactions for Protein: P23560

BDNF, Brain-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNFP23560 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDNFP23560 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDNFP23560 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDNFP23560 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDNFP23560 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDNFP23560 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDNFP23560 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDNFP23560 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDNFP23560 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDNFP23560 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDNFP23560 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BDNFP23560 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDNFP23560 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDNFP23560 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BDNFP23560 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDNFP23560 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDNFP23560 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDNFP23560 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDNFP23560 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BDNFP23560 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BDNFP23560 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BDNFP23560 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BDNFP23560 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BDNFP23560 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BDNFP23560 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BDNFP23560 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BDNFP23560 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BDNFP23560 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BDNFP23560 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BDNFP23560 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BDNFP23560 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BDNFP23560 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BDNFP23560 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BDNFP23560 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BDNFP23560 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BDNFP23560 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BDNFP23560 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BDNFP23560 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BDNFP23560 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BDNFP23560 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BDNFP23560 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BDNFP23560 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BDNFP23560 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BDNFP23560 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BDNFP23560 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BDNFP23560 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms