Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DESP17661 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DESP17661 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DESP17661 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DESP17661 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DESP17661 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DESP17661 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DESP17661 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DESP17661 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DESP17661 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DESP17661 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DESP17661 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DESP17661 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DESP17661 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DESP17661 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DESP17661 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DESP17661 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DESP17661 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DESP17661 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DESP17661 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DESP17661 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DESP17661 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DESP17661 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DESP17661 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DESP17661 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DESP17661 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms