Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPN2P17655 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms