Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Hoxb5P09079 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb5P09079 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms