Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QW42 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QW42 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QW42 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QW42 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QW42 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QW42 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QW42 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QW42 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QW42 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QW42 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QW42 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QW42 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QW42 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QW42 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QW42 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QW42 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QW42 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QW42 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QW42 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QW42 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QW42 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QW42 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QW42 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QW42 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QW42 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QW42 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QW42 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QW42 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QW42 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QW42 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QW42 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QW42 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QW42 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QW42 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QW42 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QW42 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms