Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm20795J3QP49 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20795J3QP49 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gm20795J3QP49 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm20795J3QP49 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm20795J3QP49 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm20795J3QP49 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm20795J3QP49 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm20795J3QP49 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm20795J3QP49 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20795J3QP49 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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