Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Y9

Krt83, Keratin 83, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt83E9Q1Y9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt83E9Q1Y9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt83E9Q1Y9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt83E9Q1Y9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt83E9Q1Y9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt83E9Q1Y9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt83E9Q1Y9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt83E9Q1Y9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt83E9Q1Y9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt83E9Q1Y9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt83E9Q1Y9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt83E9Q1Y9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms