Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L13C9JLJ4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms