Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOLGA6BA6NDN3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms