Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms