Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1C5

CYP2D7, Putative cytochrome P450 2D7, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2D7A0A087X1C5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP2D7A0A087X1C5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2D7A0A087X1C5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms