Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NUDCQ9Y266 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms