Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCNL1Q9UK58 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms