Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APEX2Q9UBZ4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms