Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms