Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAPAQ9P0L0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAPAQ9P0L0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms