Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASF1BQ9NVP2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASF1BQ9NVP2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms