Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVAQ9NVD7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms