Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF3Q9NR81 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF3Q9NR81 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF3Q9NR81 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF3Q9NR81 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF3Q9NR81 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF3Q9NR81 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF3Q9NR81 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF3Q9NR81 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms