Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4F12Q9HCS2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F12Q9HCS2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F12Q9HCS2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F12Q9HCS2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F12Q9HCS2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F12Q9HCS2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F12Q9HCS2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F12Q9HCS2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F12Q9HCS2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4F12Q9HCS2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F12Q9HCS2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F12Q9HCS2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4F12Q9HCS2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms