Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SyncQ9EPM5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SyncQ9EPM5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms