Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp11Q9CZJ1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Utp11Q9CZJ1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp11Q9CZJ1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp11Q9CZJ1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp11Q9CZJ1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp11Q9CZJ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms