Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr55Q9CX97 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr55Q9CX97 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms