Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700029F12RikQ9CRB4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms