Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYCP2Q9BX26 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SYCP2Q9BX26 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYCP2Q9BX26 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms