Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP9Q99956 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUSP9Q99956 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms