Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRQ99707 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRQ99707 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRQ99707 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRQ99707 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRQ99707 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRQ99707 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRQ99707 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRQ99707 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRQ99707 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRQ99707 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRQ99707 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRQ99707 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRQ99707 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRQ99707 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRQ99707 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRQ99707 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRQ99707 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRQ99707 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRQ99707 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRQ99707 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRQ99707 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRQ99707 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRQ99707 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRQ99707 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRQ99707 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRQ99707 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRQ99707 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRQ99707 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRQ99707 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRQ99707 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRQ99707 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRQ99707 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRQ99707 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRQ99707 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRQ99707 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRQ99707 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRQ99707 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRQ99707 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRQ99707 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRQ99707 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRQ99707 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRQ99707 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRQ99707 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRQ99707 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRQ99707 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRQ99707 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRQ99707 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRQ99707 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRQ99707 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRQ99707 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRQ99707 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRQ99707 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRQ99707 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRQ99707 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRQ99707 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRQ99707 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRQ99707 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRQ99707 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRQ99707 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRQ99707 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRQ99707 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRQ99707 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRQ99707 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRQ99707 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRQ99707 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRQ99707 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRQ99707 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRQ99707 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRQ99707 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRQ99707 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRQ99707 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRQ99707 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRQ99707 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRQ99707 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRQ99707 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRQ99707 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRQ99707 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRQ99707 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRQ99707 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRQ99707 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRQ99707 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRQ99707 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRQ99707 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRQ99707 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRQ99707 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRQ99707 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms