Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms