Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAP1L3Q99457 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L3Q99457 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms