Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UIMC1Q96RL1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UIMC1Q96RL1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms