Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP8Q96LD8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms