Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX11Q96FC9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX11Q96FC9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms