Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SGF29Q96ES7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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