Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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HDAC10Q969S8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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HDAC10Q969S8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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HDAC10Q969S8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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HDAC10Q969S8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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HDAC10Q969S8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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HDAC10Q969S8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC10Q969S8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC10Q969S8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC10Q969S8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC10Q969S8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC10Q969S8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC10Q969S8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC10Q969S8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC10Q969S8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC10Q969S8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC10Q969S8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC10Q969S8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC10Q969S8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC10Q969S8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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