Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDKL2Q92772 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL2Q92772 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms