Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF12Q8WXF0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF12Q8WXF0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms