Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX3LQ8TDB6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms